A área da REMP vem sofrendo impactos negativos desde a colonização da Ilha até os dias atuais, através de desflorestamentos, aterramentos e despejos de resíduos. A criação da Reserva Extrativista Marinha do Pirajubaé, em 1992, não evitou que as intervenções antrópicas continuassem, apenas reduziu o ritmo crescente da degradação ambiental em curso. Para auxiliar a manutenção das funções ambientais deste rico ecossistema, a presente dissertação de Mestrado, defendida na Universidade Federal de Santa Catarina em 2002, foi elaborada, munida de propostas de exploração, visitação e conservação ecologicamente saudáveis, através da implantação do Ecoturismo, envolvendo a população do entorno no planejamento e considerando as decisões e ações do Instituto Brasileiro de Meio Ambiente e Recursos Naturais Renováveis - IBAMA, atual mantenedor da área. Para tanto, foram estudados a categoria da Unidade de Conservação em que se insere a REMP, os ecossistemas de manguezal e baía e as técnicas de elaboração de um plano de manejo. Sob o enfoque do Ecoturismo, a gestão através do planejamento contempla impactos da visitação, equipamentos afins, recursos humanos para operacionalização, desenvolvimento de comunidades integradas no processo, promoção do destino ecoturístico e administração do visitante, complementada pela certificação ambiental da norma internacional ISO 14000. Na análise da área de estudo, foram pesquisados a localização, os limites, os aspectos físicos, os ecossistemas abrangidos e uma avaliação da gestão atual. Considerados os tópicos estudados, foi proposta uma melhoria na gestão da REMP, baseada nos princípios do Ecoturismo, através do planejamento e posterior implantação de um sistema de gestão ambiental, com vistas à obtenção da certificação ISO 14.001.

Fonte: BRASIL, Cristina. A Gestão Ecoturística na Reserva Extrativista Marinha do Pirajubaé - Florianópolis - SC: uma proposta para uso sustentável da área. Florianópolis, 2002. 117p. Dissertação (Mestrado em Engenharia de Produção e Sistemas_ - Programa de Pós-Graduação em Engenharia de Produção e Sistemas, Universidade Federal de Santa Catarina.